アップロード後のサイトのレイアウトが崩れている

必要なデータがアップロードできていない可能性があります。
下記の操作を行ってください。

1.差分検知機能をリセット
該当のサイトのサーバー設定画面を開き、右下「差分検知機能をリセット」ボタンでリセットします。
※サイトが削除されるような操作ではありませんので、ご安心ください。

2.ブラウザのキャッシュを削除
使用しているブラウザのキャッシュ(履歴)を削除し、ブラウザを終了してください。

3.再アップロード
サイトエディタ画面右下「アップロード」より再アップロードを行ってください。
完了後、正常にアップロードされているかご確認ください。